Uluslararası havacılık kurallarına göre Türkiye Hava Sahasındaki uçuş emniyetinin sağlanması ve hava trafik akışının güvenli ve hızlı bir şekilde temini yönüyle Havalimanımız 03-21 pistimizde ILS (Localizer, Glide Slope, Orta Marker ve Dış Marker), VOR, 2 Adet DME ve NDB cihazları bulunmaktadır. Havalimanımıza bağlı Seyrüsefer istasyonları, elektronik cihaz ve sistemlerin arızalarının giderilmesi, Periyodik bakım/onarımlarının yapılması, işletilmesi ile uluslararası standart ve performanslarda çalıştırılması Malatya Havalimanı Müdürlüğü Elektronik Şefliği ATSEP personelleri kadrosu ile yürütülmektedir. Ülkemiz hava sahasını kullanan hava araçlarına daha çağdaş ve güvenilir bir hava trafik hizmeti verilebilmesi için tüm teknolojik gelişmeler sürekli olarak takip edilerek Havalimanımız ve çevre seyrüsefer istasyonlarındaki elektronik sistem ve teçhizatlarına ilaveler ve modernizasyonlar yapılmaktadır.