Malatya Havalimanı Hava Trafik Kontrol Kulesi 7.Ana Jet Üs Komutanlığına ait olup Uluslararası Havacılık kurallarına göre Türkiye Hava Sahasındaki uçuş akışının temini amacıyla 03/21 pistinde 21 L ILS Sistemi(Localizer,Glıde Path,Marker), VOR,DME,NDB Cihazları, Hava/Yer Haberleşmesinde kullanılan Telsizler ve AFTN Sistemiyle hizmet vermektedir.